| Asociación de un solo marcador es una herramienta simple que calcula la asociación de marcadores única entre los marcadores SNP individuales. |
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Asociación de un solo marcador Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- Thomas Mailund
- Sitio web del editor:
- http://www.daimi.au.dk/~mailund/qdist.html
Asociación de un solo marcador Etiquetas
Asociación de un solo marcador Descripción
La asociación de un solo marcador es una herramienta simple que calcula la asociación de marcadores única entre los marcadores SNP individuales. Una sola asociación de marcadores es una herramienta simple que calcula la asociación de marcadores única entre marcadores SNP individuales y una caja / control Dichotomy.USAGE: la herramienta lee dos archivos como entrada, el primero es un conjunto de casos y el segundo caso de haplotipos de control. El formato de los archivos es una línea por haplotipo, donde los datos SNP se representan como 0 o 1, separados por espacio en blanco. · La herramienta sale una lista de estadísticas para cada marcador · El número de marcador (de izquierda a derecha en los datos de entrada) · La frecuencia del alelo 0 para los casos del archivo · Las estadísticas de la tabla de contingencia de Chi-Square para el marcador · El CDF De las estadísticas de Chi-Square · El valor P de la instalación de estadísticas (1-CDF): la herramienta SMA está escrita en C ++. Debe compilar cualquier sistema similar a Unix. Para instalar, descargue el código fuente y desembale (TAR XZF SMA-V.TAR.GZ, donde V es el número de versión de SMA), luego ejecute realice en el Subdirectory SMA-V creado durante el desempaquete. Lo que está nuevo en esta versión: · Soporte para datos genotipo (inconfundido).
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