CLC Bioinformatics Cube CLC Bioinformatics Cube ejecuta Smith Waterman hasta 125 veces más rápido que una computadora de escritorio de 3 GHz
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CLC Bioinformatics Cube Clasificación y resumen

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Velocidad aumentar bioinformática Trabajo de bioinformática Búsqueda similar a la explosión Aumentar la velocidad de bioinformática.

CLC Bioinformatics Cube Descripción

CLC Bioinformatics Cube ejecuta Smith Waterman hasta 125 veces más rápido que una computadora de escritorio de 3 GHz A través del uso innovador de la tecnología FPGA, hemos creado un cubo que dirige a Smith Waterman hasta 125 veces más rápido que una computadora de escritorio de 3 GHz, y aceptablemente cerca de la velocidad de explosión. Por lo tanto, las búsquedas de Smith Waterman que toman 14 horas en el escritorio se reducen a unos 7 minutos en el cubo. Este es un avance para la bioinformática basada en el escritorio, ya que brinda a los investigadores la posibilidad de correr búsquedas similares a una calidad significativamente mayor que antes. Nuestra comparación entre Blast y Smith Waterman muestra que la ejecución de Blastp con el valor de expectativa predeterminado de 10 a menudo resulta en solo la mitad de la mitad de los hits que ejecutan una búsqueda de Waterman Smith en el cubo. Además, al usar el cubo en lugar de la explosión, podrá mejorar la calidad de los datos con los que está trabajando. Aquí hay algunas características clave de "CLC Bioinformatics Cube": · Este enfoque innovador para el hardware basado en FPGA- La bioinformática acelerada proporciona flexibilidad en una variedad de formas: · Ubicación física: No es necesario una sala de servidores enfriada. Todo lo que necesitas es una pequeña habitación en su escritorio. · Sistema operativo: conecte a cualquier tipo de computadora a través del puerto USB, ya sea que esté ejecutando Mac OS X, Linux o Windows. · Uso del software: el cubo bioinformático se puede utilizar como Una parte integrada de todos los bancos de trabajo de CLC BIO, o a través de una interfaz de línea de comandos. · Incluso puede personalizar el flujo de trabajo del cubo mediante el desarrollo de complementos de Cube especializados con la ayuda de nuestro kit de desarrollador de software. · Rendimiento por dólar: obtendrá un poco sin paralelo Rendimiento por dólar, en comparación con las soluciones de computación de alta velocidad existentes en el mercado. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Choque fijo en secuencias de consulta muy específicas.

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