CODONCODE ALINGER Una gran aplicación para el ensamblaje de secuencia, la edición de contig y la detección de mutación
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CODONCODE ALINGER Descripción

Una gran aplicación para el ensamblaje de secuencia, la edición de contig y la detección de mutación. CODONCODE ALIGNER es un programa para el ensamblaje de secuencia, la edición de contig y la detección de mutación, disponible para Windows y Mac OS X. aligner es compatible con Fred-PhRAP y compatible completamente con puntajes de calidad de la secuencia, al tiempo que ofrece una interfaz de usuario familiar y fácil de aprender .CODONCODE ALINGER le permite aprovechar al máximo los algoritmos modernos para el ensamblaje de llamadas y secuencias de base, sin forzarlo para aprender opciones de línea de comandos complicadas o programación de PERL. Aquí hay algunas características clave de "CodonCode Aligner": · Importar secuencias de archivos de texto. · Importar secuencias de archivos ABI y SCF. · Clip final. · Vector TRIM. · Ensamblar contigs. · Alinearse a una secuencia de referencia. · Alinee contigs entre sí mientras mantiene los enlaces a las trazas. · Montar o alinear en grupos, según los nombres de la muestra. · Encuentra mutaciones heterocigotas. · Analizar inserciones y eliminaciones heterocigotas. · Definir regiones de interés ("características"), por ejemplo, regiones de consenso de baja calidad. · Navegue rápidamente entre las características definidas por el usuario. · Importar y editar ensamblajes generados por phrap. · Ejecute Fred y Phrap directamente de los proyectos de alineadores. · También tiene la posibilidad de exportar características y secuencias. · Proyectos de ensamblaje compatibles con la exportación. Limitaciones: · Período de prueba de 30 días. · Puedes usar en tus proyectos solo muestras no enseseñadas. · Además, no puede guardar, exportar o imprimir en proyectos que contengan contigs, o después de que intentó cualquiera de las funciones restringidas (alineador lo advertirá primero). ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Traducción de aminoácidos para todas las muestras. · Colores de fondo basados ​​en la traducción de proteínas. · Tablas de diferencia. · Importar directamente desde GenBank. · Menú de script. · Nuevos comandos de script. · Importar 454 datos (archivos SFF). · Crea nuevas secuencias de texto. · Apoyar proyectos más grandes. · Asambleas más rápidas. · Uso automático de la memoria en Windows. · Soporte de tableta de pluma mejorado.

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