3DICSI Analice los datos de CSI rápidos y fáciles.
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3DICSI Descripción

3DICSI es una aplicación pequeña, simple y fácil de usar desarrollada para ayudarlo a interpretar datos de imágenes de cambio químico (CSI). Combina la visualización de datos, el procesamiento espectral, la localización espectral y la estimación, la cuantificación espectral junto con los procedimientos analíticos múltiples, como el análisis del componente principal (PCA) y la factorización de la matriz no negativa restringida (CNMF). En particular, CNMF proporciona una forma eficiente de recuperar patrones espectrales subyacentes que son físicamente significativos. Principales características: Entrada y visualización de datos: Importación automática de datos sin procesar 1D / 2D / 3D CSI de Philips, GE, Siemens y Bruker Scanners. Se puede importar cualquier tipo de datos desconocido al ingresar manualmente los parámetros. Cualquier formato adicional también se admite a través de complementos de terceros. Los datos de CSI y las imágenes de referencia anatómicas se registran y se muestran en la misma ventana. Cada voxel se muestra en una ventana separada, su ubicación espacial se visualiza claramente en las tres ventanas de imagen ortogonales. RECONSTRUCCIÓN DE LA IMAGEN 3D DE LAS IMÁGENES EN UNA ORIENTACIÓN. Procesamiento de datos espectrales multidimensionales: Fase constante y corrección de fase lineal. Filtrado temporal (Lorentzian, gaussiano o combinado). Alisado espacial (Hamming, Cosine, Fermi). Corrección de línea de base. Supresión de agua. Ajuste de origen PPM y llenado cero. Supresión de lípidos. Alineación máxima. Procesamiento por lotes: La secuencia de pasos de procesamiento se puede registrar en un archivo macro y aplicarse al conjunto de datos CSI. El mismo archivo macro se puede aplicar a una serie de exámenes en un modo de lote. Localización espectral: Tiempo real-facilitado en tiempo real Voxel interactivo cambiando en las 3 dimensiones. con un promedio de voxels múltiples seleccionados. Estimación espectral de un usuario Dibujado 2D / 3D Región de interés. Análisis espectral múltiple: Análisis del componente principal (PCA) para la región espectral definida por el usuario y la ROI, para identificar los componentes principales (PC) para las fuentes de variación contenidas en el conjunto de datos CSI. Pico iterativo a base de PCA Alinee el procedimiento para eliminar las variaciones de frecuencia y fase. Método de factorización de matriz no negativa restringida (CNMF) para recuperar los patrones espectrales y sus distribuciones espaciales que son físicamente significativas. Cuantificación espectral: Generación de mapas metabólicos con integración de área y PCA. Generación de mapas para la proporción máxima y para regiones definidas por el usuario. Cantificación absoluta de la concentración de metabolito utilizando el espectro de referencia. Ajuste de la escala de visualización del mapa para habilitar la comparación entre diferentes conjuntos. Integración espectral con la corrección de línea de base controlada por el usuario. Salida de datos: Varias opciones de salida de resultados, como el informe de formato HTML, la rebanada de CSI y la impresión de la imagen, muestran las funciones de copia y pegar, exportación de ASCII espectral / binaria, exportación de imagen metabólica. EXTENSIBILIDAD DEL PROGRAMA : Mecanismo enchufable para apoyar el módulo de importación de datos CSI desarrollado por terceros.

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