Alineación estadística rápida para Linux FSA es un algoritmo de alineación de secuencia múltiple probabilística.
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Alineación estadística rápida para Linux Clasificación y resumen

Alineación estadística rápida para Linux Etiquetas

Alineación estadística rápida para Linux Descripción

Anuncio publicitario La alineación estadística rápida para Linux es un software de hogar y educación desarrollado por Robert Bradley. Después de nuestra prueba y prueba, se demuestra que el software sea oficial, seguro y gratuito. Aquí está la descripción oficial para la alineación estadística rápida para Linux: FSA es un algoritmo de alineación de secuencia múltiple probabilística que utiliza un enfoque de "distancia a distancia" para alinear la proteína homóloga, el ARN o las secuencias de ADN. Mucho como métodos de reconstrucción filogenética a base de distancia, como unirse a los vecinos, construir una filogenia utilizando solo estimaciones de divergencias por pares, FSA crea una alineación múltiple utilizando solo estimaciones de homología de pares. Esto es posible gracias a la técnica de recocido de secuencia para construir una alineación múltiple de comparaciones en pares. FSA aporta las altas precisiones previamente disponibles solo para análisis a pequeña escala de proteínas o ARN a problemas a gran escala, como alinear miles de secuencias o secuencias de megabasa. FSA introduce varios métodos novedosos para construir mejores alineaciones: FSA utiliza técnicas de aprendizaje automático para estimar el espacio y los parámetros de sustitución sobre la marcha para cada conjunto de secuencias de entrada. Este método de alineación "de aprendizaje" específico "hace que la FSA sea muy robusta: puede producir alineaciones superiores de conjuntos de secuencias homólogas que están sujetas a restricciones evolutivas muy diferentes. FSA es capaz de alinear cientos o incluso miles de secuencias utilizando un algoritmo de inferencia aleatorizado para reducir el costo computacional de la alineación múltiple. Esta inferencia aleatorizada puede pasar más de diez veces más rápido que un enfoque directo con poca pérdida de precisión. FSA puede alinear rápidamente secuencias muy largas utilizando la técnica de "recocido de anclaje" para resolver los anclajes y proyectarlos con anclaje transitivo. Luego cose la alineación entre los anclajes utilizando los métodos descritos anteriormente. La GUI incluida, enojada (pantalla de alineación múltiple), puede mostrar las alineaciones intermedias producidas por FSA, donde cada carácter se colorea de acuerdo con la probabilidad de que esté correctamente alineada

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