Almejas Clasifique sus secuencias con esta herramienta.
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Almejas Clasificación y resumen

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Almejas Descripción

Clams es una aplicación práctica especialmente diseñada para ofrecerle un clasificador basado en la composición de secuencias para las secuencias metagenómicas. Las almejas funcionan al capturar firmas de cada secuencia en función de la composición de la secuencia. Cada secuencia se modela como un paseo en un gráfico de BRUIJN con propiedades subyacentes a la cadena de Markov. Las almejas capturan los parámetros estacionarios de la cadena de Markov subyacente, así como los parámetros estructurales del gráfico subyacente de BRUIJN para formar esta firma. En la práctica, para que cada secuencia se abarquee, tal firma se calcule y se adapta a firmas similares computadas para los conjuntos de capacitación. La mejor coincidencia que también califica las victorias de corte de distancia normalizadas. En el caso de que la mejor coincidencia no califique este corte, la secuencia permanece innegada.

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