Bissnp BISULFITE-SEQ / NOME-SEQ SNPS y COSTOSINE Llamador de metilación
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Bissnp Descripción

BISSNP se desarrolló especialmente como una herramienta útil que se basa en el kit de herramientas de análisis del genoma. BISSNP hace uso de la inferencia bayesiana con probabilidades de metilación estimadas manualmente especificadas o automáticamente estimadas de diferentes contexto de citosina para determinar los genotipos y los niveles de metilación simultáneamente. El software puede funcionar para lecturas de un solo extremo y pareado. BISSNP se desarrolla en el lenguaje de programación de Java. Principales características: Llame y resuma la metilación de cualquier contexto de citosina proporcionado (CPG, CHH, CHG, GCH ET.AL); detección precisa variante. Habilitar la recalibración de la calidad de la base y las llamadas de INDEL en la secuenciación del bisulfito; Permitir un formato de salida múltiple, archivos VCF detallados, CPG Haplotype lee el archivo para el análisis de metilación mono-alélico; Mueble, peluca y formato de cama simplificado para la visualización en el navegador del genoma de UCSC y el navegador IGV.

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