| Brújula Realiza búsquedas de motivos con la ayuda de esta herramienta. |
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Brújula Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- Giuseppe Maccari
- Sistemas operativos:
- Windows NT / 2K / XP / Vista / 7
Brújula Etiquetas
Brújula Descripción
Las brújulas (patrón complejo del software de búsqueda de secuencia) es una herramienta simple y efectiva que permite la minería de genomas enteros para la presencia de elementos complejos. La herramienta es fácil de usar, flexible, no intensiva en recursos y capaz de navegar por los genomas completos en minutos. Las brújulas aplica el conocido algoritmo de coincidencia de patrones múltiples de Wu-Manber para buscar exhaustivamente el motivo en toda la SE-QUENC. Los elementos de entrada pueden ser secuencias simples conservadas (como en el motor de explosión), secuencias parcial o altamente degeneradas, o incluso múltiples secuencias degeneradas, unidas por espaciadores de longitud variable mal conservados. Esta pequeña aplicación proporcionará los siguientes tipos de búsqueda: DAS, NCBI (base de datos) o lote.
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