Citosa Administre sus modelos metabólicos con la ayuda de esta herramienta
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enchufar espectador manipulador Plugin citoscape

Citosa Descripción

El citoeado se construyó como un complemento de citoscape que puede ayudarlo a ver, manipular y analizar modelos metabólicos creados utilizando la semilla modelo. El complemento de citoeed fue diseñado para permitir a los usuarios de la semilla modelo crear visualizaciones informativas de las redes de reacción generadas para sus organismos de interés. Los usuarios pueden cargar cualquier modelo para el que tienen acceso en la semilla modelo. El plugin de citoeed descarga los datos del modelo, las reacciones y los compuestos de la semilla del modelo y organizan las reacciones a las redes según sus correspondientes mapas de vía KEGG. Después de la carga inicial (que puede tomar varios minutos), los datos del modelo se almacenan en el escritorio del usuario en una carpeta específica para una carga rápida en sesiones posteriores. Principales características: descargando modelos de la semilla modelo; creación de sesiones de citoscape para ver modelos de visualización; Sesiones de cytoscape de ahorro y reapertura Creación y eliminación de mapas de camino; reacciones en movimiento / copia entre mapas de ruta; Ocultar / Mostrar nodos dentro de los mapas de ruta La visualización del análisis de variabilidad de flujo da como resultado varios medios; Las reacciones se colorizan en base a categorías esenciales / activas / inactivas / rellenas de espacio Capacidad para abrir modelos para múltiples organismos en una sesión de citoscape, para habilitar el análisis de modelos comparativos Visualización de los resultados del análisis de balance de flujo

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