Clustal x Esta aplicación presenta un programa de alineación de secuencia múltiple de propósito general para ADN o proteínas.
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Clustal x Clasificación y resumen

Clustal x Etiquetas

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Clustal x Descripción

Clustal X es un programa avanzado que se ocupa de alineación de secuencias múltiples de proteínas y ADN. Diseñado como una interfaz gráfica para ClustalW, el programa lleva a cabo un análisis en profundidad de secuencia, mientras que también ofrece muchas utilidades para realizar múltiples comparisons.Load adecuada de programas especializados formatsThe es capaz de trabajar con secuencias de listas, importados de archivos de los siguientes formatos: EMBL / SWISSPROT, NBRF / PIR, Pearson (Fasta), GCG / MSF (Cacharro), Clustal (* .aln), GCG9 / RSF y GDE. Durante el proceso de importación, Clustal X intenta detectar si las secuencias son nucleótidos o aminoácidos, pero no hay garantía real de que la elección será correcta. destacando inteligentemente importante elementsOnce el archivo de origen se ha cargado, la alineación de secuencias se mostrará en la ventana principal del programa. El incorporada en la combinación de colores sirve para destacar características conservadas, haciéndolos estallar hacia fuera a través de colores vivos. Con el fin de distinguir el contenido de las secuencias, se recomienda que utilice un tipo de letra más grande; esto se traducirá en una vista ampliada de secuencia, por lo que es más fácil de detectar su composición. Fáciles las operaciones de alineación procesoLa permitidos por el programa make bastante la lista; puede añadir una secuencia a una alineación, corte existente o pegar un fragmento, así como para buscar una cadena, o eliminar las lagunas existentes. Además, puede realizar alineaciones a través de uno de los métodos siguientes: completa (la secuencia se someterá a un análisis completo), única guía árbol o una realineación de las secuencias seleccionadas y / o intervalos de residuos. Se recomienda que antes de comenzar un proceso de alineación, se restablece todos los parámetros (nuevos vacíos, huecos de proteínas) con el fin de que los resultados sean concluyentes. Analizar los datos y obtener una calidad de alineación scoreOne del indicativo más importante del análisis será el nivel de calidad de alineación, que se representa de forma individual para cada columna. Una puntuación alta designa una columna bien conservadas, mientras que los niveles bajos de conservación se indican mediante una puntuación más baja. En conclusionHowever, el análisis depende de una variedad de parámetros, que se fijará de acuerdo con el propósito científica que necesita ser llevado a cabo. En definitiva, el programa hace una gran opción para los científicos, así como los estudiantes que están buscando para hacer un portador de la secuenciación del ADN. Comentado por Andreea Matei, última actualización el 21 de julio, 2014

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