Colagenista

Buscar secuencias CLP en nucleótidos
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Colagenista Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Freeware
  • Nombre del editor:
  • Anna Vlasova
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
  • Tamaño del archivo:
  • 25 KB

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Colagenista Descripción

CF, que es realmente corta para Collagenfinder, se desarrolló como una pieza de software fácil de usar basada en Perl que permite a sus usuarios encontrar secuencias CLP en una secuencia de nucleótidos dada. Collagenfinder es una herramienta que puede escanear la secuencia de nucleótidos en los seis marcos de lectura posibles. Los procedimientos de filtro adicionales proporcionan predicción de CLP más precisa: · Detectar para un residuo de triptófano y codones de parada y eliminar los CLP correspondientes, · Valor de corte por número de repetición de GXY. Si necesitamos CLP con la longitud 36 y más debemos usar el valor de corte igual a 4.


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