Color de malva

MAVEVE - Alineación de la secuencia del genoma múltiple. Comparación de la secuencia del genoma
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Color de malva Clasificación y resumen

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  • GPL
  • Nombre del editor:
  • Aaron Darling
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
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  • 5.2 MB

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Color de malva Descripción

Malve es un sistema para construir de manera eficiente múltiples alineaciones genomas en presencia de eventos evolutivos a gran escala, como reorganización e inversión. La alineación de múltiples genomas puede proporcionar una base para la investigación en genómica comparativa y el estudio de la dinámica evolutiva en una nueva escala. Alinear los genomas enteros es un problema fundamentemente diferente que alinear secuencias cortas. Mauve se ha desarrollado con la idea de que un alineador de múltiples genomas debe requerir solo recursos computacionales modestos. Emplea las técnicas algorítmicas que se escalan bien en la cantidad de secuencia alineadas. Por ejemplo, un par de y. Los genomas Pestis se pueden alinear en menos de un minuto, mientras que un grupo de 9 genomas enterobacterianos divergentes se puede alinear en unas pocas horas.


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