Conífera

Calcule fácilmente el número de lecturas de secuenciación
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Conífera Clasificación y resumen

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  • Niklas Krumm
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  • Windows All
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Conífera Descripción

Conífere, también sabe que la inferencia de números de copia de EXOME LEADS es una herramienta basada en Python que utiliza datos de secuenciación de exome para encontrar variantes de número de copia (CNV) y genotipo el número de copia de genes duplicados. A medida que las reacciones de captura de exome están sujetas a sesgos de captura sinceros y sistemáticos entre lotes de muestra, implementamos la descomposición del valor singular (SVD) para eliminar estos sesgos en datos de exome. Conífero ofrece la capacidad de mezclar la secuencia de exome de múltiples carreras experimentales eliminando los sesgos por lotes. Junto con un alineador de lectura breve, como MrsFast, que puede alinear lee a múltiples ubicaciones, ConiFer puede detectar RÁPIDOS RÁPIDOS y estimar el número de copia de genes duplicados hasta ~ 8 copias con kits de captura de exome actuales.


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