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Bowtie es un software de alineación de lectura corta de eficiencia de la memoria eficiente para alinear las secuencias de ADN cortas (lecturas) al genoma humano a una tasa de aproximadamente 25 millones de lecturas por hora en una estación de trabajo típica con 2 gigabytes de memoria. Ahora, puede usar esta herramienta de comandos basada en la línea para alinear rápidamente sus secuencias de ADN. También puede crear archivos por lotes para realizar las operaciones que requieren varios parámetros. Bowtie también admite modos de alineación locales, gigantescos y emparejados.

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