Cvit Ver cromosomas con la ayuda de esta herramienta
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Cvit Clasificación y resumen

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espectador vista cromosoma Secuencia del genoma

Cvit Descripción

CVIT, Short para la herramienta de visualización de cromosomas está diseñada como una aplicación Perl que se puede usar para generar rápidamente imágenes PNG que muestran funciones en una variedad de mapas o en secuencias genómicas. Es intencionalmente simple y no interactivo, aunque es posible envolver cvit dentro, por ejemplo, las páginas web interactivas. La entrada consta de uno o más archivos de datos en formato GFF3. Los datos deben contener registros que describen uno o más "cromosomas" (que podrían representar un grupo de enlace, psuedomolécule, BAC, contig, cualquier tipo de estiramiento contiguo de ADN, o incluso una estructura de proteínas). Estos "cromosomas" son la columna vertebral en la que se colocan las características. CVIT mostrará cualquier sistema de coordenadas contiguo, incluidos pares de base, centimorganos (mapas genéticos) y centimcclintOks (mapas citogenéticos). Las coordenadas pueden correr hacia adelante (más pequeñas a más grandes) o hacia atrás (más grandes a las pequeñas). La salida consiste en una imagen PNG del cromosoma (s) y las características, una imagen de leyenda y una lista de coordenadas de características.

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