Dnadistree Un software para la inferencia filogenia a base de distancia de las secuencias de ADN.
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Dnadistree Clasificación y resumen

Dnadistree Etiquetas

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Dnadistree Descripción

Dnadistree está diseñado para inferir árboles filogenéticos a base de distancia que muestran relaciones topológicas precisas entre las especies. Más precisamente, Dnadistree realiza varios pasos sucesivos: 1. Lee alineaciones de secuencia de ADN (nucleótidos o codones); 2. Estima que las distancias imparciales del pares entre cada par de secuencias. Para ese objetivo, Dnadistree utiliza numerosas fórmulas a menudo en función de los modelos evolutivos de los modelos de ADN o codón (consulte aquí para obtener más detalles); 3. Construye árbol filogenético gracias a cuatro algoritmos aglomerativos; 4. Calcula medidas estadísticas relacionadas con las matrices de distancia y / o árboles a base de distancia. Sin embargo, Dnadistree no está diseñado para estimar las longitudes robustas de la rama; Se recomienda usar Fitch (en el paquete PHYLIP), FASTME, PHIML o PAML con los árboles inferidos por DNADISTREE como árbol de usuario para estimaciones de longitud de rama más precisas a distancia o ML. ¡Dale a DNADISTREE un intento de ver de qué es realmente capaz!

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