ErminjAnalizar genes con esta aplicación. | |
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Erminj Clasificación y resumen
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- Licencia:
- Freeware
- Nombre del editor:
- Paul Pavlidis
- Sistemas operativos:
- Windows All
- Tamaño del archivo:
- 13.7 MB
Erminj Etiquetas
- analizador análisis expresión la expresion genica gene analizar la aplicación conjuntos Analizar el conjunto de genes Encuentra el conjunto de genes extraer subconjunto de genes buscador de subconjunto de genes Agarrar el subconjunto del gen Ver datos de genes Mostrar datos genéticos Analizar la expresión génica Correlación de genes correlacionar el gen analizar el gen Organización GENE visualización de genes comparar gen comparación de genes patrón de gen gen candidato simular mutación genética adyacencia al gen Anotación de genes Base de datos de ontología de genes Ontología de genes crear red genética generador de redes genéticas Información génica asociación de productos genéticos asociación de enfermedades genéticas traductor de identificadores genéticos Predicción de la función del gen la identificación de genes Analizar la estructura del gen Analizador de estructura genética Magno de genes Comparación de pedidos genéticos comparar el orden de los genes Contenido del gen derivado Analizar el gen de codificación de proteínas. Selección de genes Analizar conjuntos de datos genéticos. Analizar 16S Secuencia de gen de RRNA Gene Ancestral Cluster calculadora de grupos de genes gen ancestral Gene Cluster analizar datos genéticos Análisis de datos genéticos Datos de expresión micro-matriz Analizar los marcadores genéticos transferencia de genes Simular el crecimiento de la red genética duplicación de genes Analizar datos de frecuencia de genes estimar diversidades genéticas Pruebas de diversas diversidades genéticas Diversidad genética Secuencia de genes interacción gen-gen Nombre de la secuencia del gen Confiabilidad de los grupos de genes Analizar el gen modificador gen de la enfermedad del mapa visualizar gen explorar gen Ver gen
Erminj Descripción
Erminej es una herramienta práctica y fácil de usar diseñada para ayudarlo a realizar un análisis de los conjuntos de genes en los datos de micro-matriz de expresión u otros datos de gran genoma que resultan en las clasificaciones de genes. Un objetivo típico es determinar si las vías biológicas particulares están "haciendo algo interesante" en los datos. El software está diseñado para ser utilizado por biólogos con poco o ningún fondo informático. Principales características: Implementación de múltiples métodos para el análisis establecido en genes: Análisis de sobrepresentación Un método basado en remuestreo que utiliza puntajes genéticos Un método basado en rango que utiliza puntajes genéticos Un método basado en remuestreo que utiliza la correlación entre los perfiles de expresión génica (un tipo de análisis de "enriquecimiento del clúster"). Los conjuntos de genes reciben puntajes estadísticos (valores p), y se admite múltiples correcciones de la prueba. Soporte de la terminología de la ontología del gen; Los usuarios pueden elegir qué aspectos analizar. Los archivos de usuario utilizan formatos de texto simples. Los usuarios pueden modificar conjuntos de genes o crear nuevos. Los resultados se pueden visualizar dentro del software. Es fácil comparar los análisis múltiples del mismo conjunto de datos con diferentes configuraciones. Los hipervínculos definibles por el usuario se proporcionan a sitios externos para permitir una navegación más eficiente de los resultados. Para programadores, hay una interfaz de línea de comandos, así como una interfaz de programación de aplicaciones simple que se puede usar para conectar la funcionalidad de ERMINEJ a su propio código
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