Erminj

Analizar genes con esta aplicación.
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Erminj Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Freeware
  • Nombre del editor:
  • Paul Pavlidis
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
  • Tamaño del archivo:
  • 13.7 MB

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Erminj Descripción

Erminej es una herramienta práctica y fácil de usar diseñada para ayudarlo a realizar un análisis de los conjuntos de genes en los datos de micro-matriz de expresión u otros datos de gran genoma que resultan en las clasificaciones de genes. Un objetivo típico es determinar si las vías biológicas particulares están "haciendo algo interesante" en los datos. El software está diseñado para ser utilizado por biólogos con poco o ningún fondo informático. Principales características: Implementación de múltiples métodos para el análisis establecido en genes: Análisis de sobrepresentación Un método basado en remuestreo que utiliza puntajes genéticos Un método basado en rango que utiliza puntajes genéticos Un método basado en remuestreo que utiliza la correlación entre los perfiles de expresión génica (un tipo de análisis de "enriquecimiento del clúster"). Los conjuntos de genes reciben puntajes estadísticos (valores p), y se admite múltiples correcciones de la prueba. Soporte de la terminología de la ontología del gen; Los usuarios pueden elegir qué aspectos analizar. Los archivos de usuario utilizan formatos de texto simples. Los usuarios pueden modificar conjuntos de genes o crear nuevos. Los resultados se pueden visualizar dentro del software. Es fácil comparar los análisis múltiples del mismo conjunto de datos con diferentes configuraciones. Los hipervínculos definibles por el usuario se proporcionan a sitios externos para permitir una navegación más eficiente de los resultados. Para programadores, hay una interfaz de línea de comandos, así como una interfaz de programación de aplicaciones simple que se puede usar para conectar la funcionalidad de ERMINEJ a su propio código


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