Estadalign Software para análisis bayesiano de proteínas, ADN y secuencias de ARN
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Estadalign Descripción

Statalign es una aplicación avanzada y de código abierto diseñada para permitirle realizar un análisis de ADN. Las alineaciones múltiples, los árboles filogenéticos y los parámetros evolutivos se co-estiman en un marco de Monte Carlo de la cadena de Markov, lo que permite una medición confiable de la precisión de los resultados. Este enfoque elimina los artefactos comunes de los que los métodos tradicionales sufren, al costo del aumento del tiempo computacional. Estos artefactos incluyen la dependencia de la filogenia construida en una sola alineación (probablemente subóptima) y el sesgo hacia el árbol de guía sobre el cual se basa la alineación. Los modelos detrás del análisis permiten la comparación de secuencias evolutivamente distantes: el modelo de eliminación de inserción TKF92 se puede acoplar a un modelo de sustitución arbitraria. En el paquete, se incluye una amplia gama de modelos para los datos de nucleótidos y aminoácidos y el sistema de administración de plug-in garantiza que se puedan agregar fácilmente los nuevos modelos.

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