Ferox es una aplicación simple y liviana diseñada para ayudarlo a alinear conjuntos de secuencias de ADN. El mecanismo que utiliza es altamente configurable, ya que puede modificar las semillas difusas en el archivo de configuración XML. Además, Ferox se puede utilizar para alinear los genomas enteros. Dado que está construido en Java, se ejecutará en todas las plataformas principales.
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