Flexiones

Predecir los super posiciones de ligando en su PC.
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Flexiones Clasificación y resumen

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Flexiones Descripción

Las flexiones predicen la conformación y la orientación de uno de los ligandos en relación con la otra. En flexiones se supone que el ligando de referencia es rígido, por lo tanto, debe administrarse en una conformación que sea similar al estado unido. El algoritmo de superposición en Flexs requiere solo poca intervención manual. Puede integrar este conocimiento en los cálculos con flexiones mediante la realización de pasos individuales manualmente. Por lo tanto, Flexs está diseñado para trabajos interactivos en pares de ligando, así como para detección virtual basada en ligando. Las dos aplicaciones principales de Flexs son el super posicionamiento del ligando (por ejemplo, para COMFA / QSAR) y la detección virtual. Si tiene una proteína y una pequeña colocación de molécula (de modo que se llama reference-ligando) pero sin estructura de la proteína, puede tomar la estructura de referencia como una huella digital negativa del sitio activo. Las flexiones determinan la similitud entre la prueba y la estructura de referencia alineándolas. En la detección virtual, tiene un ligando de referencia y un conjunto de compuestos y está interesado en priorizar los compuestos para las pruebas experimentales.


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