Fpgsimula una población de tamaño constante | |
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Fpg Clasificación y resumen
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- Licencia:
- Freeware
- Nombre del editor:
- Jody Hey
- Sistemas operativos:
- Windows All
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- 65 KB
Fpg Etiquetas
- simulación simular simulador cruz constante volumen constante señal constante constante mutación de la población población mostrar población población mundial Exhibidor de la población mundial contador de población Reloj de población estimación de la población verificador de población popups constantes valor constante Lister de nombre constante Lista de nombre constante Nombre constante Evolución de la genética de la población. distribución de la población Calculadora constante Genética de la población Simular el cuello de botella de la población Cuello de botella demográfico Tarifa constante en forma simulador genético de poblaciones Simulador de población Dinámica poblacional monitor de población constante de inhibición determinar constante población autotetraploide simular la aceleración constante mezcla de población estimar los parámetros poblacionales Tamaño efectivo de la población estructura genética poblacional simular la población simulación de población población demográfica población genética Definir grupos de población. grupo de población población haploide Estratificación de la población analizar la población análisis de la población Simulación de la población-genética. Constante de disociación
Fpg Descripción
El nombre FPG significa la simulación genética de la población hacia adelante. FPG simula una población de tamaño constante que está experimentando diversos procesos evolutivos, que incluyen: mutación, recombinación, selección natural y migración. El significado de "adelante" en este contexto es simplemente ese tiempo, dentro de la simulación, avanza tal como lo hace en el mundo real. Esto contrasta con la simulación genética de la población coosquecente en la que el tiempo, como se representa dentro de la simulación, regresa al pasado. Las simulaciones coalescentes tienen muchas ventajas, pero son difíciles de manejar si incorporan una selección natural en múltiples sitios. FPG es útil para evaluar el impacto de la selección natural sobre patrones de variación genética. Está diseñado para poder aproximarse a las situaciones del mundo real con tamaños de población bastante grandes y altas tasas de mutación a largo plazo de ADN. El modelo de mutación es un modelo de sitios infinitos, lo que significa que ningún sitio que se segrega en la población puede recibir otra mutación. La simulación acomoda mutaciones neutras, beneficiosas y perjudiciales en varios modelos diferentes de acondicionamiento físico, incluidos los modelos aditivos, multiplicativos y epistáticos. El programa genera una amplia variedad de análisis, incluidos los niveles de polimorfismo, la heterocigosidad (observada y la esperada), las tasas de fijación y el desequilibrio de vinculación, todas realizadas para cada una de las varias categorías de mutación. Cuando se invoca la migración, se llevan a cabo varios análisis con respecto a la estructura de la población. El ciclo de vida básico se alterna entre los genomas haploides (gametos) y los genomas diploides (cygotes), y procede de la siguiente manera: - Los gametos se combinan al azar en cygotes. - La aptitud física se mide para cada cigoto en función de las mutaciones que lleva. Si el dominio se establece en 0.5, entonces el modelo es similar en la mayoría de los respetos a un modelo de selección haploide. - El éxito reproductivo es el número de gametos contribuidos a la próxima generación, y se determina para cada cygote dibujando de una distribución multinomial con expectativas que son los valores relativos de la aptitud de cada clase de acondicionamiento físico. - Se producen la recombinación y mutación durante la producción de gametos. - Si hay múltiples poblaciones, los gametos se dibujan al azar de cada población y se colocan al azar a otras poblaciones. Aquellos gametos que son desplazados por los migrantes se pierden, por lo que la migración agrega un elemento extra de la deriva genética. Este es un modelo isleño de migración. - Los nuevos cigotos están formados por unión aleatoria de gametos. Las generaciones no son superpuestas.
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