GCUA: Análisis de uso general de codones

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GCUA: Análisis de uso general de codones Clasificación y resumen

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  • James O. McInerney
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GCUA: Análisis de uso general de codones Etiquetas


GCUA: Análisis de uso general de codones Descripción

GCUA: El análisis de uso general de codones es una aplicación basada en Java a medida y fácil de usar, especialmente diseñada para realizar diversas tareas que son de uso para evaluar el uso de codones en un conjunto de genes. Puede conseguir que haga algunas cosas simples como calcular la cantidad de observaciones de un codón en particular en un gen. O puedes hacer lo mismo para el conjunto de datos combinados. También puede ver las frecuencias de uso de aminoácidos (nuevamente para cada gen o para el conjunto de datos en su conjunto). El programa también produce una matriz de distancia en función de la similitud de uso de codones en genes. Sin embargo, la característica más importante del programa es su capacidad para usar el análisis multivariado para ver la variación en el uso de codones entre los genes. Aunque es popular decir que un organismo tiene un uso en particular de codones, ahora se sabe que los genes de los organismos pueden tener más de un patrón de uso de codones y generalmente es solo mediante el uso de un método de análisis multivariado que es posible determinar los tipos de la variación contenida dentro de los datos.


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