Hapevolución

detecta interacciones entre genes genéticos de datos de haplotipos de casos-control
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  • Memorial University of Newfoundland
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  • Windows All
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  • 1.6 MB

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Hapevolución Descripción

Las enfermedades complejas involucran múltiples genes con baja penetración que se pueden distribuir sobre el genoma. La mayoría de los métodos actuales de la Asociación Haplotype, típicamente están restringidos de longitud y consisten en alelos de SNP contiguos. Estos enfoques tienen una capacidad limitada para detectar epistasis de múltiples interacciones entre genes genéticos. La evidencia reciente ha demostrado que la estructura 3-D de los cromosomas puede desempeñar un papel en permitir que los SNP interactúen con los elementos genéticos que están separados físicamente por una gran distancia. HAPEVOLUCIÓN es una aplicación profesional diseñada para implementar un algoritmo coevolutario coevolutivo (CCA) para detectar interacciones entre genes genéticos de datos de haplotipos de casos de control; Además, este algoritmo puede tolerar hasta un 15% de posiciones faltantes / ambiguas en los datos de haplotipo que surgen durante la fase de haplotipo de los genotipos. Además, el algoritmo puede calcular las asociaciones epistáticas de los genes que abarcan los cromosomas múltiples.


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