Haploview se hizo fácil.
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Haploview Clasificación y resumen

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Haploview Descripción

El análisis de haplotipos está diseñado para pruebas genéticas moleculares para identificar segmentos de ADN que comparten similitudes. Haploview se ha creado para mejorar las tareas relacionadas con dicho análisis. La aplicación es basada en Java, lo que lo convierte en la multiplataforma y no hay necesidad de pasar por un proceso de instalación. Los formatos de archivo en apoyo y las opciones son simples y al punto, con un solo panel que acepta la carga de hasta cinco archivos Formatos: vínculo estándar, volcados de datos del proyecto HAPMAP, fase o plink. También hay soporte cargando múltiples archivos aplicando la línea de comandos "-batch". Independientemente del formato de archivo elegido cargado en la aplicación, se pueden personalizar los mismos parámetros. Estos se refieren a la comparación por pares de los marcadores, que pueden estar por encima de un valor especificado por el usuario (el valor predeterminado se establece en 500kb). Un segundo parámetro se refiere a la cantidad de genotipos que faltan en individuos. Dependiendo del valor establecido por el usuario, estas personas pueden excluirse del análisis. Los ajustes de configuración adicionales están disponibles para algunos de los formatos de archivo compatibles. En el caso de que los usuarios de vínculos estándar tienen la posibilidad de habilitar las pruebas de asociación, los datos de trío familiar o cargar un archivo de prueba. Después de cargar un archivo de este tipo, hay varias pantallas disponibles, que incluyen parcela LD, haplotipos, marcadores de verificación o etiquetador (combina métodos de pares con la posibilidad de la eficiencia de los enfoques multimarquearios). Con formato de fase, la pista de información HapMap se puede descargar si hay una conexión a Internet. Funcionalidad El programa se puede utilizar para ejecutar LD y análisis de haplotipos, así como estimar la frecuencia de haplotipo en la población. La lista de funciones también admite pruebas de permutación que podrían revelar la importancia de la asociación. ConclusionHaploview es un programa con aplicaciones científicas que admiten varias tareas relacionadas con el proceso de análisis de haplotipos. Los estudiantes pueden ser utilizados por los estudiantes con el sujeto y también es flexible en términos de funcionalidad y facilidad de uso. Revisado por Ionut ILASCU, Última actualización el 7 de marzo de 2014

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