Imas Ver y analizar información genómica con la ayuda de esta aplicación.
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Imas Descripción

IMAS o el sistema interactivo de análisis multigenómico es un nuevo sistema de analítica visual especialmente diseñado para el descubrimiento del conocimiento en la información genómica. IMAS permite a los científicos genómicos analizar rápidamente un conjunto de secuencias genómicas microbianas utilizando herramientas como Glimmer, Blast, Clustalw, Primer3 y TransSTERT y para visualizar la salida de estas herramientas en un marco genómico unificado. IMAS proporciona al usuario una interfaz gráfica de zoom 1 dimensional a una secuencia genómica. El usuario puede interactuar con la secuencia para analizar la presencia de regiones de codificación, que se pueden analizar aún más por la alineación de la secuencia con bases de datos locales y remotas que se utilizan. Los resultados de la explosión se muestran en un marco gráfico unificado que permite al usuario filtrar y seleccionar BLAST HITS de interés. Los hits de explosión seleccionados se pueden obtener multializados con clustalw, y estas multialignas se muestran utilizando el marco gráfico común. Los usuarios futuros y las alineaciones de las multialignas y las alineaciones de pares pueden ser anotadas para futuras referencias, y se pueden generar informes HTML que muestran estos hallazgos. Principales características: Interfaz de usuario zoomable - ¡Rápido! ejecuta programas de análisis localmente (explosión, brillar, clustal ...) IMAS BLAST puede buscar la base de datos NCBI NR Ejecuta hmmpfam en copia local de los datos de PFAM puede crear BLAST DBS de los archivos XML Insdseq

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