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Algoritmo de cuantificación basado en wavelet para ITRAQ
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  • GPL
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  • DyWave Team
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  • Windows All
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Inútil Descripción

WQUANT es un algoritmo que utiliza un análisis basado en Wavelet para identificar y extraer señales de iones del reportero de ITRAQ para lograr la cuantificación. También es una parte integradora de la tubería de análisis de datos OCAP MS. El programa está independiente y no requiere ningún proceso de instalación separado. Por favor, simplemente extraiga el programa y ejecute "wquant.exe". El programa se compila en C ++ bajo Microsoft Windows, utilizando Visual Studio 2008. Visual Studio 2008 C ++ Runtime Library para ejecutar el programa. WQUANT tiene 5 parámetros y la sintaxis es: Whant.exe · Archivo de espectros]: Ruta completa y nombre del archivo Spectra en formato MGF. · Archivo de resultados de X! Tandem]: Ruta completa y nombre de la salida de X! Tandem. · Multiplex de ITRAQ]: Experimento de 4 plex o un experimento de 8 plex, "4" o "8". · X! Tandem E-Score Cutoff]: Corte de identificación para la cuantificación. · Método de cuantificación]: 3 maneras de calcular la intensidad de iones: "Intensidad", "trapezoid", y "AUC" el área debajo de la curva.


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