JCOMPOUNDMAPPER Algoritmos de huellas dactilares para su uso
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JCOMPOUNDMAPPER Descripción

Se creó JCOMPOUNTMAPPER para proporcionar algoritmos populares de huellas dactilares para gráficos químicos. Entre estos gráficos, podemos encontrar las huellas digitales de la búsqueda de profundidad, las huellas dactilares más cortas de la ruta más corta, las huellas dactilares de conectividad extendida, las huellas dactilares de la autocorrelación (por ejemplo, CATS2D), las huellas dactilares radiales (por ejemplo, molprint2d), el molprint geométrico, los pares de átomos y las huellas digitales de farmacóforo. JCOMPOUNTMAPPER proporciona a los exportadores para varios formatos para herramientas de aprendizaje automático, como Libsvm, LiBlinear y Weka. La aplicación permite una parametrización como la profundidad de búsqueda, los recortes de distancia o la escritura del átomo. En el caso de huellas dactilares hash, puede configurar el tamaño del espacio hash. JCOMPOUNTMAPPER para el cálculo de matrices de similitud para enfoques de agrupamiento o como formato de entrada para LIBSVM El software se puede utilizar como una biblioteca de tarro liviana o un ejecutable independiente JCOMPOUNTMAPPER se basa únicamente en el software de código abierto con una licencia liberal. Utiliza el sistema de expertos químicos del kit de desarrollo químico. El objetivo principal del programa es: · Proporcionar implementaciones estándar de huellas dactilares para experimentos de minería de datos. · Implementaciones de código abierto con una definición exacta · Herramienta de línea de comandos fácil de usar para las tareas descritas · Proporcionar una base para el desarrollo de nuevas codificaciones de huellas dactilares que pueden compararse, por ejemplo, a algoritmos con exactamente el mismo algoritmo de etiquetado.

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