 | JvirgelUn software para la simulación y análisis de los datos de proteómica |
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Jvirgel Clasificación y resumen
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Jvirgel Descripción
Jvirgel es una aplicación poderosa diseñada para determinar los puntos isoeléctricos teóricos (PI) y los pesos moleculares calculados (MW) de proteínas. También le permite visualizarlos como un mapa virtual de proteínas bidimensionales (2D). El usuario puede controlar la presentación del gel 2D calculado de forma interactiva seleccionando una gama PI / MW y una escala de tiempo electroforética de interés. Principales características: Importación de secuencias de aminoácidos de FastA-, EMBL-ARCHIVE o FROM DATOS DE PRODURICA a través de XML Predicción y visualización de las secretomas Predicción y visualización de proteomas de membrana Traducción del índice de adaptación de codones (CAI) en el tamaño de la punta de proteínas Exclusión de proteínas de membrana de la visualización Contabilidad de péptidos de señal y en la escisión de Silico que resulta en una mayor precisión de la predicción del PI y MW Exportación de geles virtuales a png- o jpg-gráficos Coincidencia de un gel experimental con un gel virtual usando diferentes algoritmos de regresión se acerca a un rango de pH / MW seleccionable por el usuario Las proteínas se pueden clasificar en grupos y todos los datos se pueden exportar en las tablas CSV o en hojas de cálculo de MS-Excel Las proteínas se pueden colorear de acuerdo con su contenido de hélices transmembranas o su probabilidad de ser secretada
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