Massxpert

Un útil software de espectrometría de masas.
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Massxpert Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Nombre del editor:
  • Filippo Rusconi
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
  • Tamaño del archivo:
  • 5.2 MB

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Massxpert Descripción

Massxpert es una aplicación de espectrometría de masas práctica y fácil de usar, especialmente diseñada para ayudarlo con sus secuencias de polímeros. Para que el programa pueda hacer frente a una variedad de polímeros posiblemente muy diferentes, tenía que escribirse usando alguna capa de abstracción entre el motor de cálculos de masa y la mera descripción de la secuencia de polímeros. Esta capa de AB-Straction se implementa con la ayuda de \ Polymer Chemistry de Nitions ", que son Les que describen precisamente cómo se debe comportarse un tipo de polímero dado en el programa y cuáles son sus entidades constitutivas. La forma en que la química polimérica de las nitios es detallada por el El usuario es el tema de un capítulo de este libro. Sin embargo, para dar una visión general rápida, aquí hay una situación simple: un usuario está trabajando en dos secuencias de polímeros, una de las proteínas de química "y otra de la química tipo \ ADN". La secuencia de proteínas lee \ ATGC ", y la secuencia de ADN lee \ CGTA". Ahora imagina que el usuario quiere calcular la masa de estas secuencias. ¿Cómo sabrá MassXpert en qué fórmula (de ahí la masa) corresponde a cada código monómero? Ahí debe ser una forma de informar a MassXpert que una de las secuencias es una proteína, mientras que el otro es un oligonucleótido de ADN: se realiza sobre la creación de un polímero SE-QUENCE; Los programas solicitan qué tipo de química se cree la secuencia. Una vez que esto \ Partage química "se ha definido por cada secuencia, MassXpert sabrá cómo manejar la pantalla gráfica de cada secuencia y los cálculos para cada secuencia. Principales características: Editor de secuencia altamente configurable utilizando Vignettes Monómeros definidos por el usuario Definición de átomos con cualquier número de pares de masa / abundancia isotópicas Definición de nuevos químicos de polímero a estrenar Escasez de secuencias de polímero utilizando agentes de escisión flexibles definidos por el usuario Fragmentación de fase gaseosa de oligómeros utilizando reglas de fragmentación flexibles definidas por el usuario Poderosa búsqueda en masa en una secuencia de polímero con valores de carga de iones asociados rangos Potente paradigma de copia / pegar que permite purificar la secuencia de polímero pegadas Cálculo del patrón isotópico de cualquier químico a partir de una fórmula


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