Mchez Detecta marcadores dominantes con esta aplicación Java
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Mchez Clasificación y resumen

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banco de trabajo marcador

Mchez Descripción

Mchezza se desarrolló como un banco de trabajo de detección de selección de código abierto y accesible para marcadores dominantes. Comprender la contribución de la selección y la adaptación molecular en la configuración del genoma, la amplia variación tiene muchas aplicaciones que van desde la salud humana hasta la conservación de las especies en peligro de extinción. Mchezza proporciona una plataforma integrada para probar marcadores dominantes para la selección. La aplicación fusiona el kernel DFDIST, un método de FST-Outleier ampliamente utilizado para detectar la selección con una interfaz inteligente y fácil de usar. Principales características: DFDIST - El núcleo de Mchezza es una versión dominante de un método de atípica FST ampliamente utilizado para detectar la selección. Soporte para la corrección multitest basada en tasas de descubrimiento falsas (FDR). La corrección multituest es fundamental para evitar una alta sobreestimación del porcentaje de valores atípicos. Aplicación de inicio web Java con una interfaz fácil de usar, directamente utilizable desde la web. Importación de datos en formato Ginepoop. Exportar datos a R o software de hoja de cálculo de uso común. Habilidad para elegir qué poblaciones y / o loci se estudian. Aproximando el promedio de la FST neutral al eliminar el potencial de loci seleccionado. Aproximando el promedio simulado FST al valor promedio que se encuentra en el conjunto de datos real incluso cuando las condiciones experimentales están lejos de las que se mantiene la fórmula teórica (por ejemplo, un número bajo de demas o el uso del modelo de mutación paso a paso). Alisado iterativo de contornos de intervalo de confianza. Generación de gráficos de calidad de publicación en varios formatos (PNG, SVG y PDF) Capacidad para usar múltiples núcleos de CPU al ejecutar DFDIST.

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