Mcrate Calcule la tasa evolutiva relativa con la ayuda de esta herramienta.
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Mcrate Clasificación y resumen

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Mcrate Descripción

El grado en que un sitio de aminoácidos es gratuito para variar es firmemente dependiente de su importancia estructural y funcional. Es poco probable que un aminoácido que desempeña un papel esencial, como uno dentro del sitio activo de la proteína, es poco probable que cambie sobre el tiempo evolutivo. Por lo tanto, la tasa evolutiva en un sitio de aminoácidos es indicativo de cuán conservado es este sitio, y a su vez, permite evaluar la importancia de este sitio para mantener la estructura o la función de la proteína. Mcrate es una herramienta práctica y fácil de usar especialmente diseñada para calcular la tasa evolutiva relativa en cada sitio utilizando un modelo evolutivo basado en probabilística. Esto permite tener en cuenta el proceso estocástico que subyace a la evolución de la secuencia dentro de las familias de proteínas. Lo más importante es que Mcrate utiliza la metodología de la cadena MONTE CARLO (MCMC) de Markov para integrarse sobre el espacio de todos los árboles posibles. Por lo tanto, Mcrate no asume un árbol filogenético preexistente bajo el cual se relacionan las secuencias. Se encontró que McRATE era superior a través de métodos de NA? Ve que se basan solo en un solo árbol.

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