Mdl lenguaje de dinámica molecular
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Mdl Clasificación y resumen

Mdl Etiquetas

simulación idioma Simulación de la dinámica molecular. Dinámica molecular

Mdl Descripción

Permite a los usuarios representar simulaciones de dinámica molecular (MD) a un nivel alto El lenguaje de la dinámica molecular (MDL) está destinada a permitir que los usuarios representen simulaciones de dinámica molecular (MD) a un nivel alto. Esto incluye la capacidad de interactuar directamente con simulaciones en ejecución y prototipos de nuevos esquemas de integración utilizando varios métodos diferentes, incluidos los objetos y las funciones que actualizan los conjuntos de posición y velocidad. El idioma se basa en Python y utiliza un conjunto de bibliotecas envueltas por SWIG desde el Marco de Software Protomol, desarrollado en parte para cumplir con los requisitos de rendimiento pesado de los cálculos de fuerza de largo alcance. Añadir y probar nuevos algoritmos de evaluación de la fuerza a través del diseño modular de MDL, así como nuevos protocolos de simulación. La API incluye la funcionalidad para acceder a datos de simulación, información y datos de salida en diferentes archivos y formatos, agregar gráficos de datos, agregar diferentes tipos de fuerzas a los integradores individuales, use integradores existentes del marco de protomol en Python y convertir vectores de datos en matrices de datos rápidos .

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