ModelTest Una herramienta para seleccionar el mejor modelo de sustitución de nucleótidos
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ModelTest Clasificación y resumen

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sustitución de URL selección Sustitución de texto sustitución proporción de nucleótidos Sustitución de Trichview Cifrado de sustitución Cifras de sustitución de turnos secuencia de nucleótidos Manager de secuencias de nucleótidos nucleótido sustitución parcial Sustitución de la unidad Sustitución monoalfabética Modelo de sustitución de nucleótidos Motivo de nucleótidos modelo de sustitución compleja Sustitución de nucleótidos Marco de selección de modelos Probabilidad jerárquica Anotación de nucleótidos Modelo de sustitución de ADN Alineamientos de nucleótidos Modelo de ADN de sustitución Sustitución sinónimo Sustitución no hídón modelo de sustitución Polimorfismos de nucleótidos mutación de nucleótidos fracción de nucleótidos

ModelTest Descripción

ModelTest es una pieza de software avanzada y confiable desarrollada para servir a los ingenieros genéticos para determinar las diferencias entre los modelos de sustitución del ADN utilizando las pruebas de hipótesis jerárquica para generar los resultados. Interfaz de línea de comando La aplicación es bastante compleja, ya que está destinada a usuarios experimentados con un conocimiento de fondo sólido en genética, así como computadoras, específicamente, ya que no proporciona a los usuarios una GUI, ejecutándose solo a través de la interfaz de la línea de comandos, lo que puede hacerlo bastante desafiante para los novicios. No obstante, ModelTest no requiere la instalación, por lo que es suficiente para que los usuarios simplemente sueltan el archivo ejecutable en una instancia abierta del símbolo del sistema y presione la tecla ENTER, que a su vez revelará las funciones del programa junto con una breve explicación de los comandos disponibles. Funciones y parámetros de ejecución ModelTest está destinado a trabajar con archivos generados por PAUP * que contiene la información de genética requerida, así como los archivos que comprenden puntuaciones de registro en bruto junto con las estimaciones de parámetros para los modelos evaluados. En el extremo opuesto, la utilidad genera una descripción de las pruebas de relación de probabilidad que se realizaron, y sus valores P correspondientes, información que luego se interpreta y se le asigna un modelo adecuado. Los modelos compatibles se enumeran en la interfaz de la línea de comandos, incluidos JC (JUKES y CANTOR), TRNEF (Tamura-Nei con frecuencias de base iguales), TIM (modelo de transición), GTR (tiempo general reversible), F81 (Felsenstein) y varios más . Al mismo tiempo, los usuarios pueden trabajar con un conjunto específico de funciones, ejemplificadas en la ventana principal para que sean más fáciles de entender y emplear. Como tal, los usuarios pueden determinar el nivel de depuración (-D), el nivel alfa (-A), el número de taxa (-t), active el modo de calculadora LRT (-L), determine el intervalo de confianza para el promedio (-W) o use BIC en lugar de AIC para todas las operaciones futuras (-b). Un instrumento integral para determinar el modelo de sustitución adecuado Para concluir, ModelTest es una aplicación eficiente desarrollada para profesionales que trabajan en el campo de la genética, ofreciéndoles los medios para comparar los modelos de sustitución del ADN, lo que ayuda a los usuarios a decidir qué mejor se adapte a sus datos.

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