Multigeneblast

Identificar homólogo de módulos de múltiples genes, como los operones y los grupos de genes.
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Multigeneblast Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Precio:
  • Free
  • Nombre del editor:
  • By MultiGeneBlast
  • Sistemas operativos:
  • Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
  • Requerimientos adicionales:
  • None
  • Tamaño del archivo:
  • 11.7 MB
  • Descargas totales:
  • 95

Multigeneblast Etiquetas


Multigeneblast Descripción

MultigeneBlast es una herramienta de código abierto basada en un reformateo de los encabezados FASTA de las entradas de proteínas NCBI Genbank, utilizando las cuales puede rastrear su nucleótido de origen y coordenadas. Multigeneblast puede ayudar en la detección de tales partes multigeneas para proyectos de biología sintética. Se puede crear una biblioteca sintética de operones en función de su producción para identificar aquellos operones cuya función es la más cercana a la deseada por el usuario. Esta herramienta proporciona las oportunidades para identificar todas las regiones genómicas homólogas mediante la combinación de los resultados de las ejecuciones individuales de BlastP en cada gen, y clasificando las regiones genómicas de cualquier entrada de GenBank por el número de hits, la conservación de la sintonía y la puntuación acumulada de la broca. Las búsquedas de arquitectura se pueden realizar para encontrar cualquier región genómica con hits de explosión a cualquier combinación de secuencias de aminoácidos especificada por el usuario.


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