Musita Otra herramienta de bioinformática para ayudarlo con su trabajo.
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Musita Descripción

Musita es una aplicación basada en Java fácil de usar, diseñada para ofrecer una herramienta de bioinformática para predecir tanto los sitios de fosforilación de proteínas específicas generales y quinasa. Principales características: Para abordar las diversas limitaciones de las herramientas actuales al aplicar a los proteomios y utilizar mejor la gran magnitud de los sitios de fosforilación verificados experimentalmente, desarrollamos un musito de sistema de aplicación independiente único, diseñado específicamente para la predicción a gran escala de ambos generales y sitios de fosforilación específicos de la quinasa. El músico utilizó los patrones de similitud de la secuencia local (puntajes de KNN) y las características genéricas (puntajes de trastorno y frecuencias de aminoácidos) de los sitios de fosforilación, y emplean un enfoque integral de aprendizaje de máquinas para hacer predicciones. Confirmamos el hallazgo anterior que los sitios de fosforilación se ubican preferentemente en regiones desordenadas sobre datos de fosfoproteómica en seis organismos. Musita es la primera herramienta que proporciona utilidad para capacitar un modelo de predicción de sitio de fosforilación de los datos propios de los usuarios y admite el ajuste continuo de los niveles de rigurosidad. Musite ofrece una interfaz gráfica gráfica fácil de usar, lo que facilita que los biólogos realizaran predicciones de una manera automatizada. Las aplicaciones de la musita en seis proteomas produjeron decenas de miles de sitios de fosforilación putativos con alta rigatidad. Estas predicciones proporcionan hipótesis útiles para las validaciones experimentales. Las pruebas de validación cruzada muestran que la musita supera significativamente las herramientas existentes para predecir los sitios de fosforilación general y es al menos comparable a aquellos para predecir sitios de fosforilación específicos de la quinasa. Además, como un software de código abierto, el musita también se puede servir como una plataforma abierta para construir la solicitud de aprendizaje de la máquina para la predicción del sitio de fosforilación.

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