 | NgstoolsHerramientas para el análisis de datos NGS |
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Ngstools Clasificación y resumen
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- Licencia:
- Freeware
- Nombre del editor:
- Bioinformatics Lab
- Sistemas operativos:
- Windows All
- Tamaño del archivo:
- 77 KB
Ngstools Etiquetas
Ngstools Descripción
NGStools es un paquete basado en Java que está dirigido a proporcionar un modelo de objeto para permitir diferentes tipos de análisis de los datos de secuenciación de próxima generación. El paquete también ofrece algunos programas de utilidad para procesar lecturas alineadas a diferentes genomas de referencia. Las herramientas más importantes en este paquete son SNVQ, un algoritmo de detección y genotipante precisos de un solo nucleótido (SNV) de las llamadas de base y las puntuaciones de calidad y una regla establecida para combinar las alineaciones de lectura a una biblioteca de transcripciones de CCDS con alineaciones de las mismas lecturas a una referencia montaje. El formato de elección para procesar alineaciones en cada herramienta en este paquete es SAM, que permite integrar NGStools con programas de mapeo comúnmente usados como Bowtie y otros paquetes de análisis como SamTools.
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