Organizador Viral Genome Navegador del genoma para usar a través de Java
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Navegador navegar navegador de java Navegador del genoma Genoma explorar el genoma

Organizador Viral Genome Descripción

Organizador de genoma viral o VGO creado para ser un navegador de genoma basado en Java fácil de usar. Puede usarse para mostrar información sobre un genoma, incluidos sus genes, orfs y codones de inicio / detención. También se puede utilizar para realizar una búsqueda de expresión regular, una búsqueda de motivos difusos y una búsqueda en masa. Debido a que VGO habla con nuestra base de datos de secuencias de genoma (COV), se puede usar para comparar los genomas. Principales características: Ver los genes y predecir orfs en una o una serie de genomas. Muestra los codones de inicio y detención de la pantalla dentro de la secuencia Buscar secuencias dentro de los genomas usando expresiones regulares; e.g ggatcc o ttttt t usando un patrón de búsqueda difuso; p.ej. Ggatcc permitiendo un desajuste para los genes con el más alto en la composición Use una GUI para seleccionar y extraer regiones de un genoma Mostrar ortólogos en un conjunto de genomas utilizando la GUI para seleccionar un gen en otro genoma Muestra una parcela de composición de nucleótidos. Busque el oligonucleótido más largo compartido entre una serie de genomas no alineados Busca en el genoma traducido para los partidos a los péptidos de especificaciones en masa Muestra gráficamente los datos de otros programas en la parte superior de la pantalla del genoma

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