Pepkefinder Ubica picos (sitios de unión a cohesión) en los datos de microarry de la levadura.
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Pepkefinder Clasificación y resumen

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Descubridor locador enlace de protocolo alter Mostrar enlace de protocolo Encuadernación del protocolo cima Seleccionar encuadernación vinculación de esquí implementar la unión Rendererman unión Mecanismo de unión flexible el enlace de datos vinculante C ++ a Lua enlace crear unión generar unión biblioteca vinculante Qt 4 enlace Enlace .NET conjunto de encuadernación Gemelo Peaks Screensaver Twin Peaks API API ABOINTING Enlace qt enlace de pitón localizar el pico encontrar pico localizador de pico Ver picos cromatográficos Análisis de picos cromatográficos API de base de datos enlace tri picos ja texto creador de mosaico caída de ácido 1.0 Cortador de tono de llamada N73 descarga navegador Tor USB quitar de forma segura Adobe Acrobat5 serie nero plugin coja escritor php extractor de archivos NRG taller de carrocería Sims3pack controlador universal Ethernet controlador bluetooth ivt

Pepkefinder Descripción

La aplicación PeakFinder se desarrolló para ser una herramienta que localiza los picos (sitios de unión a la cohesión) en los datos de microarry Chip (inmunoprecipitación de cromatina). PeakFinder es una herramienta de visualización genoma que busca datos de relación de microarrays para "picos". Los picos se encuentran utilizando una curva suavizada que se puede elegir de forma interactiva. El contenido de nucleótidos que utiliza una ventana móvil específica se puede mostrar junto con los resultados de la micromatriz. El programa es casi genérico para cualquier genoma, pero aún tiene unos parámetros de solo levadura. Archivos de entrada: - Archivo Genomeindex.dat: Las coordenadas cuentan la ubicación de cada cromosoma dentro del genoma. También se especifica la ubicación del centrómero. - "Coordenadas de características" Hoja de trabajo de Excel: las columnas A, B y C deben ser NOMBRES, coord1, coord2. Las coordenadas son coordenadas del genoma para cada característica. - Hoja de trabajo de Excel de "Ratios" con datos de microarray: la columna A debe ser "INAME". Se supone que los datos de la relación se encuentran en la última columna. Los valores "Iname" de la característica deben mecellorar los especificados en la hoja de trabajo de coordenadas de características. - Directorio con secuencias de nucleótidos, un archivo para cada cromosoma. Los datos de secuencia pueden estar en formato FASTA con un desembolso, o simplemente un archivo ASCII. Los nombres de los archivos deben ser CHR * o CHRNN *. Por ejemplo, chr05.fsa, o chrviii_562639.ascII. El formato de archivo "antiguo" o "nuevo" de la base de datos genoma de Saccharomyces es aceptable. - PeakFinder.ini está en el directorio C: \ Documentos y configuraciones \ Configuración local \ Datos de aplicación \ StowersInstitute \ PeakFinder Archivos de salida: - El gráfico se coloca automáticamente en el portapapeles, si se selecciona la opción de mapa de bits o metarfile, y se puede pegar de inmediato en cualquier otra aplicación después de que se muestre. (Desmarcar el cuadro GUARDE AUTOMÁTICO, detiene esta colocación automática de la tabla en el Portapapeles). De lo contrario, presione el botón Guardar en la hoja de tablas de la tabla para guardar la tabla en un archivo GIF específico. - El botón Guardar Peaks en la hoja de pestaña PEAKS se puede seleccionar para guardar un archivo Peinta.csv, que se puede abrir en Excel. - El botón "Proceso todos" en la hoja de pestaña Rawdata da como resultado un conjunto de archivos que se están produciendo. Normalmente, especifique un nuevo directorio y contendrá estos archivos cuando se complete el procesamiento: ratiofilename.dat, ratiofilename-chromosomenn.gif (nn = 01 a 16), y ratiofilename-pico.csv, donde RatiofileName es el nombre de la proporción de Excel Archivo especificado en la hoja de tablas de datos sin procesar.

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