| Pretendiente Selección de modelos mejor en forma de evolución de proteínas. |
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Pretendiente Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- The University of Vigo
- Sistemas operativos:
- Windows All
- Tamaño del archivo:
- 3.3 MB
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Pretendiente Descripción
Prottest (ModelTest's relative) es un programa para seleccionar el modelo de evolución de proteínas que mejor se adapte a un conjunto dado de secuencias (alineación). Los modelos incluidos son matrices empíricas de sustitución (como WAG, LG, MTREV, Dayhoff, DCMUT, JTT, VT, BLOSUM62, CPREV, RTREV, MTMAM, MTART, HIVB y HIVW) que indican tasas relativas de reemplazo de aminoácidos y mejoras específicas. (+ I: sitios invariables, + g: tasa heterogeneidad entre sitios, + f: frecuencias de aminoácidos observadas) para explicar las restricciones evolutivas impuestas por la conservación de la estructura y la función de la proteína. Prottest utiliza el criterio de información de Akaike (AIC) y otras estadísticas (AICC y BIC) para encontrar cuáles de los modelos candidatos mejor se adaptan a los datos a mano. ¡Dale a Prottest a tratar de evaluar completamente sus capacidades!
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