Pssat

La alineación de las secuencias de proteínas se hizo fácil.
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Pssat Clasificación y resumen

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  • Ben Morris
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Pssat Descripción

PSSAT es una aplicación pequeña, simple, muy fácil de usar especialmente diseñada para ayudarlo a alinear dos proteínas, utilizando la producción de estructura secundaria predicha por Psipred. Desarrollado en Haskell, utilizando WxHaskell para GUI. Esta herramienta creará una alineación visual global o local de dos proteínas, utilizando las siguientes técnicas novedosas: · Utiliza intervalos de confianza devueltos por Psipred para determinar las puntuaciones de la coincidencia · Penalización de la brecha afín: las alineaciones prefieren las brechas largas y continuas sobre muchas brechas cortas · Incluye secuencia de aminoácidos original para referencia. · Salida en formato HTML para ayudar en la visualización, o como texto plano


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