Rnashapes Una heurística de tiempo de ejecución para acelerar el cálculo de las probabilidades de forma acumulada
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Cálculo del número cálculo matemático forma modelo de computación ARN abstracción cálculo Anulación de cómputo Ahorro acumulado Visualizar las probabilidades Tritador de probabilidades cálculo simbólico Cálculo de R6RS Método heurístico Cálculo heurístico Detalles de cálculo cálculo científico cálculo geométrico cálculo de álgebra escáner heurístico heurístico Servicios de cálculo cálculo numérico cálculo de radiación algoritmo heurístico cálculo preciso Método heurístico de ahorro Cálculo paralelo cálculo de corte incremental Medio ambiente de cálculo Distribuir computación Cálculo var Secuencia de ARN Cálculo del valor P Cálculo de densidad establecida forma abstracción Análisis de ARN mi cálculo de estimadores probabilidades de estudio Marco de cálculo

Rnashapes Descripción

Se desarrolló RapidShapes para ser una heurística de tiempo de ejecución para acelerar el cálculo de las probabilidades de forma acumulada. La abstracción de la forma de ARN se estructura en un dominio similar a un árbol de formas, retención de adyacencia y anidación de características estructurales, pero sin tener en cuenta las longitudes de la hélice. La abstracción de la forma se integra bien con los algoritmos de programación dinámica, y por lo tanto, se puede aplicar durante la predicción de la estructura en lugar de después. Esto evita la explosión exponencial y aún puede darnos una cuenta no heurística y completa de las propiedades del espacio plegable de la molécula. RNSashapes ofrece tres poderosas herramientas de análisis de ARN en un solo paquete de software: - Cálculo de un pequeño conjunto de estructuras representativas de diferentes formas, completa en un sentido bien definido. - Cálculo de probabilidades de forma acumulada. - Predicción comparativa de estructuras de consenso, como alternativa al algoritmo sankoff sobrevalorado.

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