Robin Un preprocesador de datos de microarrays de microarray que admite todas las plataformas de microarrays comunes
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Robin Descripción

Actualmente, varios programas comerciales, como Genespring con una interfaz de usuario rica y sencilla para analizar estadísticamente, los microarrays están disponibles. Sin embargo, estos suelen ser muy caros e incluso pueden requerir una suscripción anual. Por otro lado, hay herramientas gratuitas de código abierto, como bioconductor que ofrecen excelentes opciones estadísticas y soporte de forma gratuita, pero este poder a menudo llega al precio de la usabilidad, ya que estas herramientas a menudo presentan una interfaz de línea de comandos o únicamente muy Interacción básica del usuario. Finalmente, hay herramientas como RMA Express, que ofrecen una interfaz de usuario rica, pero solo un conjunto de opciones muy limitado. Robin intenta salvar esta brecha al proporcionar una interfaz gráfica fácil de usar para liberar la potencia del R / Bioconductor para el biólogo individual. Robin viene como un archivo instalable, que también instala los marcos R y Bioconductor. Actualmente, utilizando Robin es posible normalizar los datos de AFFYMETRIX DATOS Y TABULARES GENÉRICOS o datos de matriz de un solo canal utilizando un rango de diferentes métodos de normalización. Además, Robin ofrece una variedad de métodos de control de calidad que se pueden usar para obtener una visión general de la calidad y la estructura técnica de datos experimentales. Uso del diseñador de experimentos gráficos incorporados, los investigadores pueden definir qué muestras para comparar (incluso las combinaciones de muestras son posibles) y, finalmente, producen un conjunto completo de tablas y parcelas que dan resultados detallados del experimento, como el cambio de fold (M), Valores de expresión promedio (a) en una probabilidad (ajustable por el usuario) para la expresión diferencial. Las tablas que resumen información en los 100 mejores genes regulados diferenciales y varias parcelas que visualizan la calidad de cada chip también se generan. Los resultados se pueden importar directamente en Mapman y Pageman para la visualización y un análisis adicional. Robin le ofrece una solución completa para el análisis de microarrays y el procesamiento de datos.

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