TRANSPOSONPSI Una herramienta de análisis para identificar la proteína o la homología de la secuencia de ácidos nucleicos
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EDITAR Por TRANSPOSONPSI es una herramienta de análisis para identificar la homología de la secuencia de proteínas o de ácido nucleico a proteínas codificadas por diversas familias de elementos transposibles. PSI-BLAST se usa con una colección de perfiles de homología de ORF (retro retro) para identificar alineaciones estadísticamente significativas. Este método se puede utilizar para identificar posibles orfs de transposón dentro de un conjunto de proteínas, o para identificar las regiones de la homología del transposon dentro de una secuencia del genoma más grande. Esto es particularmente útil para identificar homologías de transposón degenerado dentro de las secuencias del genoma que escapan la identificación y el enmascaramiento mediante el uso de repetición de repetición y una biblioteca de nucleótidos asociados de elementos repetitivos. TRANSPOSONPSI se ha utilizado de forma rutinaria en el Instituto de Investigación Genómica para ayudarlo en el descubrimiento de elementos móviles a través de eucariotas, incluidos protozoos, plantas, hongos y animales.

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