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Tfsearch visor Descripción

Los elementos reguladores de CIS se pueden enriquecer en las secuencias ascendentes de un conjunto de genes que muestran patrones de expresión similares, esto se puede hacer mediante la búsqueda de sitios de unión al factor de transcripción (TFBS) en las secuencias ascendentes de los genes SYN-expresados. TFSearch Viewer es una herramienta a medida que se basa en Java diseñada para enviar múltiples secuencias a TFSearch Server automáticamente, luego busca TFB comunes entre los resultados de búsqueda de todas las secuencias, proporcionando evidencia de co-regulación del conjunto de genes a través de factores de transcripción a nivel de transcripción . El archivo de resultados muestra los recuentos de cada TFB identificados en cada secuencia, los TFBS están clasificados por su aparición entre todas las secuencias enviadas, por lo tanto, al 100% de la ocurrencia para un TFB significa que el sitio de unión se puede detectar en todas las secuencias.

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