Vmd molecular VMD es un programa de visualización molecular para mostrar, animar y más.
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Vmd molecular Clasificación y resumen

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Vmd molecular Descripción

VMD está diseñado para la visualización y análisis de los sistemas biológicos, como las proteínas, los ácidos nucleicos, los conjuntos de bicaplas lipídicos, etc., se puede usar para ver más moléculas generales, ya que VMD puede leer Archivos de banco de datos de proteínas estándar (PDB) y muestran la estructura contenida. VMD proporciona una amplia variedad de métodos para la representación y la molécula para colorear. Se puede usar VMD para animar y analizar la trayectoria de simulaciones de dinámica molecular (MD), y puede manipular de manera interactiva las moléculas que se simulan en computadoras remotas (MD interactivo). Las características clave de VMD incluyen: Soporte para todas las principales plataformas informáticas. Soporte para procesadores multinúcicos. Soporte para cálculo acelerado GPU. Muchos excelentes tutoriales de VMD desarrollaron localmente, y por la comunidad de investigación en general Sin límites en el número de moléculas, átomos, residuos o número de marcos de trayectoria, excepto la memoria disponible Muchos métodos de representación molecular y colorante. Capacidad de pantalla estéreo Sintaxis de selección de átomos extensos para elegir subconjuntos de átomos para mostrar (incluye operadores booleanos, expresiones regulares y más) Soporte para más de 60 formatos de archivos moleculares y tipos de datos a través de una extensa biblioteca de complementos y traductores de lectores / escritores incorporados. VMD incluye un complemento de alineación de secuencia múltiple, un entorno de análisis de bioinformática unificado que permite organizar, mostrar y analizar datos de secuencia y estructura de proteínas y ácidos nucleicos. Capacidad para exportar gráficos mostrados a los archivos que pueden ser procesados ​​por una serie de paquetes de rayos de rayos de rayos populares, incluyendo POV-RAY, RAYSHADE, RASTER3D y TACHYON. Interfaces de usuario gráficas y de texto extensibles de usuario, TCL / TK y lenguajes de scripting de Python estándar integrados Extensiones al lenguaje TCL que permite a los investigadores escribir sus propias rutinas para el análisis molecular.

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