 | carnacPredecir la estructura secundaria para un conjunto de secuencias de ARN homólogas |
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carnac Clasificación y resumen
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- Bonsai Bioinformatics group
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carnac Descripción
Carnac es una herramienta de software para analizar la hipotética estructura secundaria de una familia de ARN homólogo. Su objetivo es predecir si las secuencias realmente comparten una estructura secundaria común. Cuando existe esta estructura, Carnac puede recuperar correctamente una gran cantidad de los tallos plegados. La entrada es un conjunto de secuencias de ARN de varátoras que no necesitan estar alineadas. La estrategia plegable se basa en un modelo termodinámico con minimización de energía. Combina información proveniente de elementos conservados localmente de la estructura primaria y información mutua entre secuencias con covariaciones también. ¡Obtenga Carnac y pruébelo para usted ver qué tan útil puede ser para usted!
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