filtrante Herramienta para evaluar la celularidad de la muestra del tumor de las matrices SNP
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Snp

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QPure se desarrolla como un paquete R accesible y práctico que le permite estimar la pureza del tumor o la celularidad utilizando los datos de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) de muestras de tumor / paredes normales. Las ventajas de usar el método QPure para la estimación de la celularidad del tumor es que es un enfoque estadístico imparcial que mide directamente el contenido del tumor de la muestra que se extrajo el ADN. Nuestro estudio reciente (manuscrito en preparación) sugiere que el método QPure es una herramienta esencial para estimar la celularidad del tumor antes de realizar la secuenciación de alto rendimiento en las muestras de cáncer. Esta viñeta proporciona una introducción al estilo tutorial a la función en el paquete QPure. Las funciones proporcionan la puntuación de QPure para cada muestra, dado su genoma, SNP Pro Les como Generado de Illumina SNP Chips.

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