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caTIES o el texto del Cáncer Información del Sistema de Extracción es un proyecto centrado en dos retos importantes problemas de bioinformatics.The que quieren ser superadas están relacionados con la extracción de información de texto libre y el acceso al tejido. Específicamente, caTIES tiene tres objetivos primarios: · Extracto de información codificada de texto libre quirúrgicos informes de patología (SPR), utilizando terminologías controladas para poblar estructuras de datos caBIG conformes. · Proporcionar a los investigadores la posibilidad de consultar, examinar y crear pedidos de datos tejido anotado y material físico a través de una red de fuentes federadas. Con caTIES la SPR actúa como un localizador de recursos de tejido. · La investigación pionera para la extracción de información de texto distribuido en el contexto de caBIG. Principales características: Características de codificación: Semánticamente códigos de texto con conceptos del NCI Metathesaurus. Clasifica conceptos como el diagnóstico, procedimiento o Organ tipo codificados. Utiliza un motor incorporado de la negación para identificar la negación explícita en el texto. Características Buscar: búsquedas basadas Apoyos concepto. Además de devolver los resultados que contienen los términos de búsqueda, búsquedas basadas concepto también devuelven los resultados que contienen sinónimos de los términos de búsqueda. soporta la búsqueda de conceptos negado. Por ejemplo, puede buscar 'adenocarcinoma negada', que proporcione resultados que tenían una negación explícita para el adenocarcinoma. declaraciones es decir, como "no hay evidencia de adenocarcinoma" o "adenocarcinoma no encontrado" debe estar presente en el informe. compatible con las consultas temporales. Por ejemplo, se puede consultar en los pacientes que no tenían evidencia de tirotrópicos adenoma de menos de 3 años antes de ser diagnósticos con el cerebro Hemangioma tiene un gráfico de consultas única herramienta de modelado para formular consultas complejas con facilidad. Usos ontología información para mejorar los resultados de búsqueda. Para. p.ej. buscando 'vasculitis' volverá informes con todos los sub tipos de vasculitis, incluso si la palabra 'vasculitis' no está presente en el informe. Limitar las búsquedas dentro de ciertas secciones del informe. soporta el etiquetado de los informes y luego en busca de informes con etiquetas específicas. Otras características: caTIES pantalla caTIES captura de pantalla (click para ampliar imagen más grande) caTIES es de código abierto. puede importar datos de archivos HL7. texto Deidentifies para cumplir con las regulaciones de HIPAA utilizando programas de terceros de identificador. Tiene un cliente pesado rico que está en línea accesible a través de Java Webstart. Se utiliza protocolos de cifrado seguros para proteger a todas las comunicaciones. Capacidad para utilizar contraseñas seguras y registrar toda la actividad de búsqueda con fines de auditoría. Apoyos para el tejido de las operaciones bancarias y agente honesto. Admite múltiples nodos caTIES en todas las organizaciones. Soporte totalmente integrado para

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