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paxtools Descripción

Paxtools es una aplicación utilizada para el formato de intercambio de datos para la información de la vía biológica. BIOPAX es un lenguaje estándar que tiene como objetivo permitir la integración, el intercambio, la visualización y el análisis de los datos de la vía biológica. Específicamente, BIOPAX admite el intercambio de datos entre los grupos de datos de la vía y, por lo tanto, reduce la complejidad del intercambio entre los formatos de datos al proporcionar un formato estándar aceptado para los datos de la vía. Al ofrecer un estándar, con semántica bien definida para la representación de la vía, Biopax permite que las bases de datos de vías y el software interactúen de manera más eficiente. Además, BIOPAX permite el desarrollo de la visualización de la vía de las bases de datos y facilita el análisis de datos generados experimentalmente a través de la combinación con el conocimiento previo. El esfuerzo de la biopax se coordina estrechamente con la de las demás iniciativas de estándares relacionados con la ruta, a saber,; PSI-MI, SBML, CELLML y SBGN para ofrecer un estándar compatible en las áreas donde se superponen.


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