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Una herramienta para la secuencia de ARN síncrona y la alineación y edición de la estructura secundaria
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4Venta Descripción

En el análisis de secuencia, la alineación múltiple crea el fundamento de todos los análisis de procedimientos. Los errores en una alineación podrían influir fuertemente en todos los análisis sucesivos y, por lo tanto, podrían provocar predicciones equivocadas. Las alineaciones hábiles y mejoradas a mano son necesarias y, mientras tanto, buenas prácticas comunes. Para las secuencias de ARN, a menudo, la secuencia primaria, así como una estructura secundaria, el consenso es bien conocido, por ejemplo, la estructura de hoja de trébol del T-ARN. Recientemente, se proponen algunos editores de alineación que puedan incluir y modelar ambos tipos de información. Sin embargo, con el advenimiento de una gran cantidad de secuencias de ARN confiables junto con sus estructuras secundarias resueltas (disponibles a partir de la base de datos de ITS2), nos enfrentamos al problema para manejar secuencias y sus estructuras secundarias asociadas de forma síncrona. 4Sale llena esta brecha. La solicitud se desarrolló para permitir una secuencia rápida y una alineación de estructura secundaria síncrona para grandes conjuntos de datos y para la primera edición manual sincrónica de secuencias alineadas y sus estructuras secundarias. Este estudio describe un algoritmo para la alineación síncrona de las secuencias y sus estructuras secundarias asociadas, así como las características principales de 49ale utilizadas para análisis y edición adicionales. 4Sale construye un punto de partida óptimo y único para cada análisis de secuencia de ARN y estructura. 4Sale, que proporciona una interfaz fácil de usar e intuitiva, es una caja de herramientas completa para el análisis de ARN basado en la secuencia y la información de la estructura secundaria.


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